พระราชวังนครปฐม อยู่ทางทิศตะวันออก ติดกับบริเวณพระปฐมเจดีย์ มูลเหตุที่สร้างพระราชวังนี้ สมเด็จ ฯ กรมพระยาดำรงราชานุภาพทรงกล่าวไว้ ในหนังสือเรื่องตำนานวังเก่าว่า พระราชวังนี้ทรงสร้างเนื่องในการปฏิสังขรณ์พระปฐมเจดีย์ด้วย พระบาทสมเด็จพระจอมเกล้า เจ้าอยู่หัวทรงพระราชดำริว่า พระมหาเจดีย์เป็นสถานที่บรรจุพระบรมธาตุของพระพุทธเจ้าสร้างแต่แรก พระพุทธศาสนามาประดิษ ฐานในประเทศนี้ แต่ก่อนพระสถูปเจดีย์นั้นร้างกลายเป็นป่าเปลี่ยว แต่ประชาชนยังเลื่อมใส ไปบูชาพระปฐมเจดีย์มิได้ขาด จึงทรง พระราชศรัทธาโปรดฯ ให้ปฏิสังขรณ์พระปฐมเจดีย์ทั่วบริเวณและโปรดฯ ให้ขุดคลองมหาสวัสดิ์ คลองเจดีย์บูชา ให้การคมนาคม ระหว่างกรุงเทพฯ และนครปฐมสะดวกขึ้น ถึงกระนั้นการที่ปมาระหว่างกรุงเทพฯ กับนครปฐมในสมัยนั้น ต้องค้างคืนกลางทาง หนึ่งคืนจึงถึงจำเป็นต้องสร้างที่ประทับแรมขึ้นที่พระปฐมเจดีย์ จึงโปรดฯ ให้สร้างพระราชวังขึ้นที่บริเวณพระปฐมเจดีย์ทำนอง เดียวกับพระราชวัง ซึ่งพระมหากษัตริย์ ครั้งกรุงศรีอยุธยาทรงสร้างที่ริมบริเวณพระพุทธบาท และทรงพระราชทานนามว่า "พระ นครปฐม" ครับ